Acesse o menu suspenso do módulo de Vendas e NF-e, e clique em "Exibir Todas" no grupo de Nota Complementar e de Ajuste:
Selecione as notas que deseja excluir e clique em "Excluir os Complementos ou Ajustes Selecionados":
Caso você queria excluir todos os registros, é possível selecioná-los de uma vez:
⚠️ Caso tenha algum registro atrelado, não será possível realizar a exclusão. Caso a nota tenha sido faturada; cancelada, também não será possível realizar a exclusão